Détection et isolement des virus A(H1N1)v en France

En France, la recherche de virus A(H1N1)v est réalisée pour les cas classés comme possibles ou probables selon des critères clinico-épidémiologiques.  Sur la base de la détection d’un virus influenza A par RT-PCR ciblant le gène M, les cas classés comme probables ont fait l’objet d’analyses virologiques complémentaires. Ainsi, par RTP-CR en temps réel, parmi les 2 124 signalements, 11 et 7 prélèvements ont été trouvés positifs pour les virus grippaux saisonniers A(H1N1) et A(H3N2) respectivement, et la présence du nouveau virus A(H1N1)v a été confirmée pour 58 cas à l’aide d’une RT-PCR spécifique du gène H1v du nouveau virus développée par les CNR (données au 5 juin 2009).

Analyse génétique et antigénique des virus A(H1N1)v

L’analyse des séquences nucléotidiques disponibles pour l’ensemble des segments des virus isolés de cas français (4 génomes complets, et 3 génomes partiels) comme des virus isolés ailleurs dans le monde ne révèle pas de différences significatives (identité > 99%). Par ailleurs, il n’y a aujourd’hui aucune évidence de l’existence de réassortiments du nouveau virus A(H1N1)v avec des virus saisonniers ou des virus d’autres sous-types tels que les virus de grippe aviaire A(H5N1) [10].

Les analyses antigéniques par tests d’inhibition de l’hémagglutination à l’aide de sérums de furet post-infectieux indiquent que les virus A(H1N1)v sont antigéniquement très proches [11].  Ils ne réagissent pas avec des sérums post-infectieux dirigés contre les virus A(H1N1) saisonniers. Une étude menée aux États-Unis a montré que 6 à 9% des adultes de 18 à 64 ans et 33% des personnes de plus de 60 ans présentent des anticorps neutralisant le nouveau virus A(H1N1)v, alors qu’aucun enfant de moins de 18 ans ne présente de réactivité croisée [12].  La présence d’anticorps capables de neutraliser le virus A(H1N1)v chez les personnes de plus de 60 ans pourrait refléter l’existence d’une mémoire immunitaire vis-à-vis des virus A(H1N1) ayant circulé dans les années 1950, antigéniquement proches des virus du lignage porcin classique. Néanmoins, en dépit de la présence d’un composant A(H1N1) dans le vaccin contre la grippe saisonnière, ce vaccin ne permet pas d’induire une protection contre le nouveau virus A(H1N1)v et l’utilisation d’un vaccin spécifique du virus A(H1N1)v sera nécessaire pour protéger la population. Un tel vaccin est en cours de développement et ses modalités d’utilisation restent à évaluer lors d’essais cliniques appropriés.

Sensibilité aux antiviraux des virus A(H1N1)v

Pour l’ensemble des virus A(H1N1)v, l’analyse des séquences disponibles montre la présence dans la protéine M2 d’une substitution Ser31Asn connue pour conférer la résistance aux inhibiteurs du canal à protons, l’amantadine et la rimantadine. L’analyse des séquences du gène N1v pour l’ensemble des virus A(H1N1)v ne montre la présence d’aucune mutation connue associée à une résistance ou à une réduction de la sensibilité vis-à-vis des inhibiteurs de neuraminidase, l’oseltamivir ou le zanamivir. En particulier, la présence d’une His en position 275 de la N1v indique une sensibilité à l’oseltamivir, contrairement à la grande majorité des virus A(H1N1) saisonniers qui possèdent dans leur N1 une Tyr275 associée à une résistance à l’oseltamivir, mais non au zanamivir. Ces analyses génétiques sont corroborées par des données d’analyses phénotypiques [10,13]. 

Conclusion

L’émergence d’un virus antigéniquement nouveau à capacité de diffusion rapide laisse craindre l’initiation d’une nouvelle pandémie grippale. Même si aujourd’hui la sévérité apparaît modérée et que le virus ne présente aucun des déterminants de virulence connus, l’acquisition d’une virulence accrue par mutations ou par des événements de réassortiment à l’occasion de co-infections  avec des virus saisonniers ou encore avec des virus A(H5N1) est une possibilité qui nécessite une surveillance attentive de l’évolution de ce nouveau virus.